Her şeyden önce çocuk olmasına mani olan faktörün ortaya konması gerekir. Bundan sonra tedavisine geçilir. Öncelikle ameliyatla düzeltilmesi gereken bir neden varsa bunun yapılması gerekir. Örneğin tıkanıklık varsa bunu düzeltmeden ne kadar ilaç kullanılırsa kullanılsın faydası olmaz. Kullanılacak ilacın mutlaka bir nedeni olmalı, yani bir eksikliği gidermelidir. Bilmeden ilaç kullanımı zararlı olabilir. Aşağıda erkek kısırlığında ne zaman ilaç kullanılacağı özetlenmiştir:

• İltihap durumlarında antibiyotikler ve antiinflamatuvar ilaçlar
• Hormon eksikliğinde eksik olan hormon (FSH, hCG, testosteron)
• Antisperm antikorların görüldüğü immünolojik olaylarda kortizon
• Lökosit fazlalığı ya da sperm şekil bozukluklarında antioksidanlar, E vitamini
• Sperm yapımını uyarıcı hormonlar ve hormon artırıcı ilaçlar
• Testislerde kan dolaşımını artırıcı pentoksifilin
• Spermin hareketini artırıcı kallikrein, indometazin, pentoksifilin
• Prolaktin yüksekliğinde parlodel
• Tüp bebek işlemine hazırlanırken